L’organisation académique est gérée par les facultés et les départements. Ce dernier est une unité pédagogique et de recherche regroupant l’ensemble des enseignants et des activités de recherches d’une unité spécialisée donnée. Il peut comprendre des laboratoires et/ou des équipes de recherche dont l’organisation et les modalités de fonctionnement sont fixés par décision du Président de l’Université.
Le département de génie géologique à former, 11 promotions depuis sa création en 2003, dans le domaine de la ressource en eau souterraine (Hydrogéologie) et en mines & géologie

Les enseignements théoriques assurés en classe sous forme de cours magistrales sont complétés par des séances pratiques en laboratoire ou au cours d’une mission de terrain. Le rôle joué actuellement par les différents laboratoires de la faculté de mines & géologie est purement académique. Les équipements et matériels actuellement disponible ne permettent pas de mener des recherches approfondies et utiles dans le cadre des projets de thèses.

Ce laboratoire est équipé des quelques microscopes mono et binoculaire pour les observations des lames-mines.
- Divers échantillons de roches et des minéraux spécifiques sont classifiés et identifiés en fonction de leurs contextes géographiques, géologique et leurs natures et origines pétrographiques (magmatique, métamorphique et sédimentaires).
- Des outils pédagogiques à caractère numériques (des DVD, CD Rom, de cassette vidéo VHS accompagné d’un magnétoscope, Ecran TV) sont aussi disponible pour assurer la formation pratique des étudiants.
Le département de géologie possède aussi les laboratoires suivants :
- Le laboratoire de paléontologie
- Le laboratoire de Géomatique (Cartographie & GPS)
- Le laboratoire de chimie et d’hydrochimie